1973 yılında T.C. Dışişleri Bakanlığı Siyasi İşler Dairesinde aday meslek memuru olarak göreve başladı. Belgrad, Kabul ve Pekin'deki görevlerinin ardından 1990-1995 yıllarında Birleşmiş Milletler (BM) Cenevre Ofisi nezdindeki daimi temsilcilikte müsteşar, NATO daimi temsilciliğinde müsteşar ve daimi temsil yardımcısı, Dışişleri Bakanlığı Denizcilik Dairesi Başkanlığında Daire Başkanı olarak görev yaptı. 1996’da NATO ve Türkiye ve Batı Avrupa Birliği (BAB) Elçi Genel Müdür yardımcısı oldu.
Bayer, 2000 yılında Güney Kore nezdinde büyükelçi, 2003’te İsveç nezdinde büyükelçi olarak görev yaptı.[4][5] 2004’te Uluslararası Güvenlik İşleri Genel müdürlüğünde büyükelçi genel müdür vekili ve aynı yıl Uluslararası Güvenlik İşleri Genel müdürlüğünde büyükelçi Genel Müdür olarak atandı. 2009-2013 yıllarında Birleşmiş Milletler Viyana Ofisi Nezdinde Türkiye Cumhuriyeti Büyükelçi Daimi Temsilcisi olarak Türkiye'yi temsil etti.[3][6] 17 Ekim 2022'de öldü.[7]