SIESTA ('Spanish Initiative for Electronic Simulations with Thousands of Atoms, Türkçe: Binlerce Atomlu Elektronik Simülasyon Girişimi), moleküller ve katıların üzerine ab initio moleküler dinamik simülasyonlarını gerçekleştirmek ve etkilielektronik yapı hesaplamalarını yapabilmek için tasarlanmış orijinal bir yöntem ve bu yöntemin bilgisayar programı uygulamasıdır. SIESTA'nın verimliliği, kesinlikle yerelleştirilmiş temel kümelerin kullanılmasından ve uygun sistemlere uygulanabilen doğrusal ölçekleme algoritmalarının varlığından kaynaklanmaktadır. Kodun çok önemli bir özelliği, doğruluk ve maliyetinin, hızlı keşif hesaplamalarından- düzlem dalga ve tüm elektron yöntemleri gibi diğer yaklaşımların kalitesiyle eşleşen- son derece hassas simülasyonlara kadar geniş bir aralıkta ayarlanabilmesidir.
13 Mayıs 2016'dan bu yana, 4.0 sürüm duyurusu ile SIESTA, GPL açık kaynak lisansı koşulları altında yayınlanmaktadır. Kaynak paketler ve geliştirme sürümlerine erişim yeni geliştirme ve dağıtım platformundan 13 Nisan 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi. mümkündür.
SIESTA'nın güçlü yönleri
SIESTA'nın güçlü yanları:
Esnek kod
Yoğun hesaplama gerektiren sistemler üzerinde çalışabilir
SIESTA için bir dizi işlem sonrası araç geliştirilmiştir. Bu programlar SIESTA çıktısını işlemek veya programın işlevselliğini desteklemeye yardımcı olabilir.
Uygulamalar
Uygulanmasından bu yana SIESTA, çok çeşitli sistemlere (nanotüpler, nanokümeler, biyolojik moleküller, amorf yarıiletkenler, ferroelektrik filmler, düşük boyutlu metaller, vb.) uygulandı.[1][2][3]
^Mashaghi A et al. Hydration strongly affects the molecular and electronic structure of membrane phospholipids J. Chem. Phys. 136, 114709 (2012)
^Mashaghi A et al. Interfacial Water Facilitates Energy Transfer by Inducing Extended Vibrations in Membrane Lipids, J. Phys. Chem. B, 2012, 116 (22), pp 6455–6460
^Mashaghi A et al. Enhanced Autoionization of Water at Phospholipid Interfaces. J. Phys. Chem. C, 2013, 117 (1), pp 510–514
==Konuyla ilgili okumalar
Izquierdo (2000). "Systematic ab initio study of the electronic and magnetic properties of different pure and mixed iron systems". Physical Review B. 61 (20). s. 13639.
Robles (2001). "All-electron and pseudopotential study of the spin-polarization of the V(001) surface: LDA versus GGA". Physical Review B. 63 (17). s. 172406.
Soler (2002). "The SIESTA method for ab initio order-N materials simulation". Journal of Physics: Condensed Matter. 14 (11). ss. 2745-2779.
