Film, ormanı koruyan doğaüstü yaratıklarla, doğanın kaynaklarını hızla ve acımasızca tüketen insanlar arasındaki mücadeleyi anlatır.
Mononoke bir isim değildir, Japoncada ruhlar veya canavarlar için kullanılan genel bir ifadedir.
Konu
Muromachi Japonya'da bulunan bir Emishi köyü, yaban domuzunu andıran iğrenç bir iblis tarafından saldırıya uğrar. Son Emishi prensi Ashitaka, köye ulaşmadan önce onu öldürmeyi başarır, ancak iblis ölmeden önce kolunu kavrar ve Ashitaka'yı lanetler. Her ne kadar bu lanet ona süper güçler verse de bu güç beraberinde acı da verir. Köylüler iblisin bir yaban domuzu tanrısı olduğunu ve vücuduna saplanmış bir demir topu tarafından bozulduğunu keşfederler. Köyün bilge kadını (Hī-sama) Ashitaka'ya kolundaki lanetin çaresinin ancak iblisin geldiği batı topraklarında bulabileceğini ve aksi takdirde öleceğini söyler.
Batıya doğru ilerlerleyen Ashitaka, kendisine Büyük Orman Ruhu'ndan yardım bulabileceğini söyleyen fırsatçı bir rahip olan Jigo ile tanışır. Az ötedeki bir kayalıkta, erkeklerden oluşan bir grup sığırları köylerine yani Demir Kasabasına taşıyorlardır. Tam bu sırada kurt tanrıçası Moro'nun liderlik ettiği bir kurt sürüsü erkeklerden oluşan bu kalabalığın üstüne saldırır. Ancak, kasabanın lideri olan Leydi Eboshi'nin öncülüğünde erkekler bu saldırıyı püskürtmeyi başarırlar. Geri püskürtülen kurtlar ve kurt tanrıçasının üzerindeki gizemli insan şelalenin aşağısında Ashitaka ile karşılaşır. Ashitaka her ne kadar selam da verse kurtlar Ashitaka'yı diğer insanlar gibi sanır ve selamını geri çevirip uzaklaşırlar.
Ashitaka uzaklaşan kurtların arkasından bakarken şelalenin kenarında karaya vurmuş iki kişiyi fark eder ve onları sırtladıktan sonra yoluna devam eder. Küçük bir yolculuktan sonra Demir Kasabası adını verdikleri kasabaya ulaşırlar. Burada hayranlıkla karşılanan Ashitaka, buradaki insanların demiri işlediklerini ve işledikleri bu demiri ateşli silahlar yapmak için kullandıklarını öğrenir. Ancak, demir madenleri oluşturabilmeleri için ormanları kestiklerini fark edince çok sinirlenir.Nitekim, ormanların kesilmesinden dolayı öfkelenen bir tek Ashitika değildir ve Ormanın ruhları da bu durumdan çok şikayetçidir.
Daha sonrasında Leydi Eboshi her şeyi itiraf eder. Ashitikan'ın köyüne saldıran yaban domuzunun bir zamanlar ormanın koruyucu ruhlarından biri olduğunu ve bu ruh ile nasıl savaştığını anlatır. En sonunda ise koruyucu ruhu demir bir mermi ile vurduğunu ve vurulan yaban domuzunun bu mermi yüzünden bir iblise dönüştürdüğünü anlatır. Ayrıca, kurtlarla birlikte yaşayan gizemli kişinin San olduğunu, Prenses Mononoke olarak bilindiğini, kurtlar tarafından büyütüldüğünü ve insanlardan nefret ettiğini ortaya çıkar.
San, Demir Kasabası'na sızar ve Eboshi'ye karşı savaşır, ancak Ashitaka araya girer ve ikisini de bastırır. Kaos ortamında bir köylü onu vurur, ancak lanet ona San'ı köyden çıkarmak için güç verir. San uyanır ve zayıflamış Ashitaka'yı öldürmeye çalışır, ancak onun güzelliğini övdüğünde tereddüt eder. Ona güvenmeye karar verir ve Orman Ruhu onun kurşun yarasını iyileştirir. Ertesi gün, kör tanrı Okkoto'nun liderliğindeki bir yaban domuzu klanı, ormanı kurtarmak için Demir Kasabası'nı saldırmaya planlar. Eboshi, Jigo ile birlikte Orman Ruhu'nu öldürmeye çıkar. Eboshi, tanrının başını İmparator'a (o, ona ölümsüzlük vereceğine inanır) Asano'dan korunma karşılığında vermek niyetindedir, Jigo ise sunulan büyük ödülü istemektedir.
Ashitaka iyileşir ve Demir Kasabası'nın Asano'nun samurayları tarafından kuşatıldığını bulur. Yaban domuzu klanı savaşta yok edilmiş ve Okkoto ağır yaralanmıştır. Jigo'nun adamları Okkoto'yu Orman Ruhu'na götürmesi için kandırır. San, Okkoto'yu durdurmaya çalışır ancak acısı onu bir canavara dönüştürür. Herkes Orman Ruhu'nun havuzunda çarpışırken, Ashitaka San'ı kurtarırken Orman Ruhu Moro ve Okkoto'yu öldürür. Ruh, Gece Yürüyücü'ye dönüşmeye başlarken Eboshi onu kafasını keser. Jigo kafayı çalar, ancak Orman Ruhu'nun bedeni toprağı öldüren ve dokunduğu her şeyi öldüren bir sıvı akıtır. Orman ve ruhları ölmeye başlar. Moro'nun kafası kısa bir süre canlanır ve Eboshi'nin sağ kolunu ısırır, ancak o hayatta kalır. Öfkeli bir şekilde San, Eboshi'yi öldürmeye çalışır, ancak Ashitaka tarafından durdurulur ve teselli edilir, pes etmemesi için teşvik edilir.
Demir Kasaba boşaltıldıktan sonra, Ashitaka ve San, Jigo'yu takip eder ve başı geri alır, onu Orman Ruhu'na geri getirirler. Ruh ölür ancak şekli toprağı iyileştirir ve Ashitaka'nın lanetini kaldırır. Ashitaka, Demir Kasaba'yı yeniden inşa etmeye yardım etmek için kalır, ancak San'a ormanda ziyaret edeceğine söz verir. Eboshi daha iyi bir kasaba kurma sözü verir ve orman yeniden büyümeye başlar.
