Hudut ve Sahiller Sağlık Genel Müdürlüğü, 663 sayılı Sağlık Bakanlığı ve Bağlı Kuruluşlarının Teşkilat ve Görevleri Hakkında KHK ile yeniden yapılandırılan kurum; Lozan Barış Antlaşması, Montrö Boğazlar Sözleşmesi, Uluslararası Sağlık Tüzüğü (2005), Uluslararası Çalışma Örgütü Sözleşmeleri, Cenazelerin Nakli Anlaşması gibi uluslararası mevzuat; 1593 sayılı Umumi Hıfzıssıhha Kanunu, 2548 sayılı Gemi Sağlık Resmî Kanunu gibi ulusal mevzuat çerçevesinde bulaşıcı ve salgın hastalıkların ülkeye girmesini önlemek, Türk Boğazlarını transit geçecek veya limanlara yanaşacak olan gemilere sağlık denetimi yapmak gibi temel sorumlulukları yerine getirmekle görevlidir.[1] Kurum, Sağlık Bakanlığı'na bağlı, özel bütçeli bir kuruluştur. Merkezi İstanbul'dadır.
