Harvard Doğa Tarihi Müzesi, Amerika Birleşik Devletlerinde Massachusetts eyaletindeki Cambridge şehrindeki Harvard Üniversitesi kampüsünde bulunan Üniversite Müzesi Binasında yer alan bir Doğa Tarihi Müzesidir.
Bu müzede Harvard Üniversitesinin üç doğa tarihi araştırma müzesindeki (Harvard Üniversitesi Herbaryumu, Karşılaştırmalı Zooloji Müzesi ve Harvard Mineroloji Müzesi) koleksiyonlardan alınan tür ve örnekler sergilenmektedir.
