Harry Potter, serinin 3. bölümünde, yazın sonunda görmüş olduğu dev siyah köpek yüzünden kafası fazla karışmış hâlde okula başlar. Özellikle Sihir BakanıCornelius Fudge'ın kendisi hakkında söylediği şeyler onun bir çıkmazda olduğunu göstermiştir. Hogwarts Ekspresi içindeyken Harry, Ron, Hermione bir ruh emici ile karşılaşır ve ruhu emilirken yanlarında uyuyan Remus Lupin Patronus büyüsü yaparak ruh emiciyi kovar. Okulda devamlı olarak gördüğü Ruh Emiciler ve Ron'un Scabbers adlı faresindeki gariplikler her şeyin başlangıcıdır. Tüyler ürpertici Azkaban kalesinden nasıl olduysa kaçan ve yıllar önce Lord Voldemort'un gücünün zirvesinde olduğu dönem tek lanetle 13 kişiyi ve Peter Pettigrew'ı öldüren azılı katil Sirius Black'in Lord Voldemort'un hizmetkarı olduğu sanılmaktadır. Sirius Black anlaşılamayan bir şekilde Ron Weasley'nin faresini ele geçirmeye çalışmak için Hogwarts'a gelir. Çok geçmeden Black'in bir Animagus olduğu anlaşılır. Prof. Remus Lupin ile Bağıran Baraka'da buluşan, peşlerinden Harry ve arkadaşlarını getiren Sirius (animagus hali köpektir) Scabbers'in aslında bir animagus olduğunu itiraf eder. Scabbers 12 yıl önce Sirius Black'in karıştığı olayda öldü sanılan ve Lord Voldemort'un asıl hizmetkarı olan kılkuyruk lakaplı Peter Pettigrew'dir. Pettigrew bütün o cinayetleri işlemiş ve fareye dönüşüp kaçarak kendine öldü süsü vermiştir. Aynı zamanda Harry'nin ailesine ihanet edende Peter Pettigrew'dır. Sirius, olan biten her şeyi Harry'e anlatır ve Peter, sahibinden kurtularak asıl sahibi Lord Voldemort'a kaçmayı başarır. Olayların şokunu atlatmaya çalışan Harry kısa zaman önce vaftiz babası olduğunu öğrendiği ve anne babasına ihanet ettiğini sandığı için nefret ettiği Sirius Black'in masum olduğunu öğrenir. Sirius'un kendisiyle yaşama teklifi onu hayli mutlu eder. Bu sırada Harry'nin en sevdiği Karanlık Sanatlara Karşı Savunma öğretmeni Lupin'in kurtadam olduğunu aileler öğrenir. Remus Lupin kontrolsüz şekilde dolunayda dönüşüm geçirmiş olması gerekçesiyle okuldan ayrılmak için istifa ederek Hogwarts'taki işini bırakır. Harry ve arkadaşlarına ise masum olduğuna kimsenin inanmayacağını ve ruh emicilerin onu buldukları anda saldıracaklarını bildikleri Sirius'u, hipogriff (bir atın gövdesine ve bir kartalın kanatlarıyla başına sahip uçabilen sihirli bir yaratık) Şahgaga ile okuldan kaçırma görevi düşer.Hermione'nin aldığı derslere yetişebilmesi için Profesör Mcgonagall tarafından verilen zaman döndürücüsü ile Harry ile Hermione geçmişe gider ve Sirius Black'i hem ruh emicilerden hem de hapisten kurtarır. Kitap, Sirius'un Şahgaga'nın sırtında semaya uçup uzaklara gitmesi ve Harry'nin yaz tatili için teyze ve eniştesinin evine dönmesiyle son bulur.
