Bu listede Afrika ülkesi Güney Sudan'da bulunan şehirler listelenmiştir. Güney Sudan'ın en yüksek nüfusa sahip yeri 230.195 nüfus ile başkent Cuba'dır. Aşağıda belirtilen listede şehrin daha Sudan'ın bir parçası olduğu 1973, 1983 ve 1993 resmi sayım sonuçlarının yanı sıra bölgenin 2005 yılında Güney Sudan olarak özerkliğini kazandıktan sonraki 2008 yılındaki tahmini nüfus sayım sonuçları açıklanmıştır. Ülkenin bağımsızlığını kazandığı 2011 yılından bu yana nüfus sayımı ile ilgili herhangi bir girişim gerçekleşmemiştir.