Arthrobacter

Arthrobacter
Arthrobacter chlorophenolicus SEM görüntüsü
Biyolojik sınıflandırma
Üst âlem: Bacteria Şube: Actinobacteria Takım: Actinomycetales Familya: Micrococcaceae Cins: Arthrobacter Conn & Dimmick, 1947[1]
Tip tür
Arthrobacter globiformis (Conn 1928) Conn and Dimmick 1947
Sinonimler
Siderocapsa Dubinina and Zhdanov 1975

Arthrobacter, Micrococcaceae familyasına bağlı bir bakteri cinsidir.^[2] Bu cinse ait bütün türler Gram pozitif ve zorunlu aerobiktir. Logaritmik faz boyunca çubuk iken durgun fazda kokuslardır. Arthrobacter, koparıcı bölünme adında farklı bir bölünme yöntemine sahiptir. Eski haline dönmesi (bölünme sonrasında) bakteriyel hücre duvarının yırtık noktalarının birleşmesi ile olur.

Taksonomi

Arthrobacter familyasına bağlı taksonlar (2022):

1. Arthrobacter agilis - (Ali-Cohen, 1889) Koch et al., 1995
2. Arthrobacter albidus - Ding et al., 2009
3. Arthrobacter albus - Wauters et al., 2000
4. Arthrobacter alkaliphilus - Ding et al., 2009
5. Arthrobacter alpinus - Zhang et al., 2010
6. Arthrobacter antarcticus - Pindi et al., 2010
7. Arthrobacter ardleyensis - Chen et al., 2005
8. Arthrobacter arilaitensis - Irlinger et al., 2005
9. Arthrobacter aurescens - Phillips, 1953
10. Arthrobacter bambusae
11. Arthrobacter bergerei - Irlinger et al., 2005
12. Arthrobacter castelli - Heyrman et al., 2005
13. Arthrobacter chlorophenolicus - Westerberg et al., 2000
14. Arthrobacter citreus - Sacks, 1954
15. Arthrobacter creatinolyticus - Hou et al., 1998
16. Arthrobacter cryoconiti - Margesin et al., 2012
17. Arthrobacter cryotolerans - Ganzert et al., 2011
18. Arthrobacter crystallopoietes - Ensign and Rittenberg, 1963
19. Arthrobacter cumminsii - Funke et al., 1997 emend. Funke et al., 1998
20. Arthrobacter cupressi
21. Arthrobacter defluvii - Kim et al., 2008
22. Arthrobacter deserti
23. Arthrobacter echigonensis - Ding et al., 2009
24. Arthrobacter echini - Lee vd. 2016
25. Arthrobacter equi - Yassin et al., 2011
26. Arthrobacter flavus - Reddy et al., 2000
27. Arthrobacter gandavensis - Storms et al., 2003
28. Arthrobacter gangotriensis - Gupta et al., 2004
29. Arthrobacter ginkgonis
30. Arthrobacter globiformis - (Conn, 1928) Conn and Dimmick, 1947
31. Arthrobacter gyeryongensis
32. Arthrobacter halodurans
33. Arthrobacter histidinolovorans - Adams, 1954
34. Arthrobacter humicola - Kageyama et al., 2008
35. Arthrobacter ilicis - Collins et al., 1982
36. Arthrobacter kerguelensis - Gupta et al., 2004
37. Arthrobacter koreensis - Lee et al., 2003
38. Arthrobacter liuii
39. Arthrobacter livingstonensis - Ganzert et al., 2011
40. Arthrobacter luteolus - Wauters et al., 2000
41. Arthrobacter methylotrophus - Borodina et al., 2002
42. Arthrobacter monumenti - Heyrman et al., 2005
43. Arthrobacter mysorens - Nand and Rao, 1972
44. Arthrobacter nanjingensis
45. Arthrobacter nasiphocae - Collins et al., 2002
46. Arthrobacter nicotianae - Giovannozzi-Sermanni, 1959
47. Arthrobacter nicotinovorans - Kodama et al., 1992
48. Arthrobacter niigatensis - Ding et al., 2009
49. Arthrobacter nitroguajacolicus - Kotoucková et al., 2004
50. Arthrobacter oryzae - Kageyama et al., 2008
51. Arthrobacter oxydans - Sguros, 1954
52. Arthrobacter parietis - Heyrman et al., 2005
53. Arthrobacter pascens - Lochhead and Burton, 1953
54. Arthrobacter phenanthrenivorans - Kallimanis et al., 2009
55. Arthrobacter pigmenti - Heyrman et al., 2005
56. Arthrobacter pityocampae - İnce et al., 2014
57. Arthrobacter pokkalii - Krishnan et al., 2017
58. Arthrobacter polychromogenes - Schippers-Lammertse et al., 1963
59. Arthrobacter protophormiae - (Lysenko, 1959) Stackebrandt et al., 1984
60. Arthrobacter psychrochitiniphilus - Wang et al., 2009
61. Arthrobacter psychrolactophilus - Loveland-Curtze et al., 2000
62. Arthrobacter psychrophenolicus - Margesin et al., 2004
63. Arthrobacter ramosus - Jensen, 1960
64. Arthrobacter rhombi - Osorio et al., 1999
65. Arthrobacter roseus - Reddy et al., 2002
66. Arthrobacter ruber - Liu et al., 2018
67. Arthrobacter russicus - Li et al., 2004
68. Arthrobacter sanguinis - Mages et al., 2009
69. Arthrobacter scleromae - Huang et al., 2005
70. Arthrobacter silviterrae
71. Arthrobacter soli - Roh et al., 2008
72. Arthrobacter stackebrandtii - Tvrzová et al., 2005
73. Arthrobacter subterraneus - Chang et al., 2008
74. Arthrobacter sulfonivorans - Borodina et al., 2002
75. Arthrobacter sulfureus - Stackebrandt et al., 1984
76. Arthrobacter tecti - Heyrman et al., 2005
77. Arthrobacter tumbae - Heyrman et al., 2005
78. Arthrobacter uratoxydans - Stackebrandt et al., 1984
79. Arthrobacter ureafaciens - (Krebs and Eggleston, 1939) Clark, 1955
80. Arthrobacter viscosus - Gasdorf et al., 1965
81. Arthrobacter woluwensis - Funke et al., 1997

Kullanımı

Arthrobacter crystallopoietes 2-piridonda (sağ) büyüdüğünde bir pigment üretirken süksinik asitte (sol) bu pigmenti üretmemektedir.

A. crystallopoietes' in kirlenmiş topraktaki altı değerlikli kromun (Cr⁶⁺) ve 4-klorofenol seviyesini azalttığı bilinmektedir. Bu durum bu türün biyoremidasyon için kullanımına kapı açar.^[3][4] Benzer olarak, Arthrobacter sp. suş R1 'in (Amerikan Tipi Kültür Koleksiyonu suş numarası 49987) çeşitli homosiklik bileşikleri (piridin ve pikolin içeren N heterosiklikler ve hidroksibenzoatlar gibi) de kapsamak üzere çeşitli aromatik bileşiklerde büyüyebildiği gösterilmiştir.^[5] Bunların yanında Arthrobacter sp H65-7 inülini, tıpla alakalı bir besin olan, difruktoz anhidride çeviren inülaz II enzimini üretebilir.^[6]

Dış bağlantılar

• Arthrobacter Genome Projects16 Ekim 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi. (from Genomes OnLine Database15 Ekim 2011 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.)
• Comparative Analysis of Arthrobacter Genomes (at DOE's IMG system)
• Wikimedia Commons'ta Arthrobacter ile ilgili çoklu ortam belgeleri bulunur.
• Vikitür'de Arthrobacter ile ilgili ayrıntılı taksonomik bilgiler bulunur.

Kaynakça

1. Conn HJ, Dimmick I. (1947). "Soil Bacteria Similar in Morphology to Mycobacterium and Corynebacterium". J Bacteriol. 54: 291-303. 
2. "ITIS". 30 Ekim 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 2 Haziran 2022. 
3. F.A.O. Camargo; F.M. Bento; B.C. Okeke; W.T. Frankenberger (2003). "Hexavalent chromium reduction by an actinomycete, Arthrobacter crystallopoietes ES 32". Biological Trace Element Research. 97 (2). ss. 183-194. doi:10.1385/BTER:97:2:183. PMID 14985627. 
4. K Westerberg; AM Elvang; E Stackebrandt; JK Jansson (2000). "Arthrobacter chlorophenolicus sp. nov., a new species capable of degrading high concentrations of 4-chlorophenol". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 50 (6). ss. 2083-2092. doi:10.1099/00207713-50-6-2083. PMID 11155983. 
5. O'Loughlin EJ, Sims GK, Traina SJ (1999). "Biodegradation of 2-methyl, 2-ethyl, and 2-hydroxypyridine by an arthrobacter sp. isolated from subsurface sediment". Biodegradation. 10 (2). ss. 93-104. doi:10.1023/A:1008309026751. PMID 10466198. 
6. Sakurai, Hiroaki; Yokota, Atsushi; Tomita, Fusao (2014). "Molecular Cloning of an Inulin Fructotransferase (Depolymerizing) Gene from Arthrobactersp. H65–7 and Its Expression in Escherichia coli". Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry. Cilt 61. s. 87. doi:10.1271/bbb.61.87.