År 1993 utsågs Brodd till professor i kyrkovetenskap vid Uppsala universitet och har sedan dess, bland annat, varit gästprofessor vid General Theological Seminary, New York, 1998. Han var professor vid University College Chichester, England, 1998–2003, dekanus för teologiska fakulteten i Uppsala 2000–2008 och blev tillförordnad professor i missionsvetenskap 2003.
Brodd är medlem av redaktionsråden för Kirchliche Zeitgeschichte (Göttingen), Svensk Missionstidskrift/Swedish Missiological Themes (Uppsala) och The International Journal for the Study of the Christian Church (Edinburgh).
Fullständig bibliografi se: Mattias Brodd, "Sven-Erik Brodds tryckta skrifter 1967–2015. Bibliografisk förteckning" i Ecclesiologica & alia. Studia in honorem Sven-Erik Brodd, 2015, s.373–413.
Urval:
(1972). Evangeliskt klosterliv i Sverige.. Stockholm: Verbum
(1978). Dop och kyrkotillhörighet enligt Svenska kyrkans ordning: utkast och skisser. Stockholm: Verbum
(1980). Dop - kyrka - struktur: uppsatser, föreläsningar och diskussioner. Uppsala: Pro veritate
(1982). Evangelisk katolicitet: ett studium av innehåll och funktion under 1800- och 1900-talen. Diss. Uppsala : Univ.
(1989). Pastoralteologisk praxis: om kyrkligt liv och arbete i en urbaniserad miljö. Stockholm: Stockholms församlingsdelegerade
(1990). Ekumeniska perspektiv: föreläsningar. Uppsala: Svenska kyrkans forskningsråd
(1993). Diakonatet: från ecklesiologi till pastoral praxis = The diaconate : from ecclesiology to pastoral praxis. Uppsala: Svenska kyrkans forskningsråd
(2004). "A female face of the Church: sisterhoods from an ecclesiological perspective", Nuns and sisters in the Nordic countries after the reformation : a female counter-culture in modern society. S. 355-384
(2005). Diakonen i mässan: en praktisk teologi för diakoner. Stockholm: Verbum
(2005). "Ett kvinnoansikte åt kyrkan: ecklesiologiska aspekter på ordnar och kommuniteter för kvinnor" Kvinnligt klosterliv i Sverige och Norden : en motkultur i det moderna samhället. S. 225-259