Sabrina Windmüller debuterade internationellt i kontinentalcupen (som då var den högsta nivån inom backhoppning för kvinnor) i Toblach i Italien18 januari2006. Hon blev nummer 31 i sin första tävling i kontinentalcupen. Hon tog sin första placering bland de tio bästa i en deltävling i kontinentalcupen i Saalfelden i Österrike8 februari2007 där hon blev nummer 9. Windmüller har tävlat 6 säsongen i kontinentalcupen. Säsongen 2009/2010 är hennes bästa hittills. Då blev hon nummer 19 sammanlagt.
Den första världscupen för damer arrangerades säsongen 2011/2012. Öppningstävlingen i världscupen avhölls i normalbacken i Lillehammer3 december2011. Den historiska tävlingen vanns av Sarah Hendrickson från USA. Windmüller deltog inte i den första världscuptävlingen, men vann den andra, i Hinterzarten7 januari2012, 0,8 poäng före Lindsey Van från USA. Sabrina Windmüller blev nummer 20 sammanlagt i den första världscuptävlingen för damer. Sarah Hendrickson vann sammanlagt före Daniela Iraschko och Sara Takanashi från Japan.