Församlingen har medeltida ursprung. Mellan 1992 och 2002 var församlingens namn Lena-Bergstena församling.
Församlingen var till 1962 moderförsamling i pastoratet Lena, Bergstena och Fullestad som mellan omkring 1500 och 1882 även omfattade Långareds församling. Från 1962 till 1992 var den moderförsamling i pastoratet Lena, Bergstena, Fullestad, Hol, Siene och Horla.[4] Församlingen utökades 1992 med Bergstena församling och fick då namnet Lena-Bergstena församling med samma pastoratsomfattning som tidigare. År 2002 uppgick utökades församlingen med Fullestads församling och återfick då namnet Lena församling. Den ingår sedan dess i Vårgårda pastorat.[5]
^Stift, kontrakt och pastorat i nummerordning med ingående församlingar 2020-01-01, SCB, läs online.[källa från Wikidata]
^ [ab] Medlemmar i Svenska kyrkan i förhållande till folkmängd den 31.12.2019 per församling, kommun och län samt riket, Svenska kyrkan, läs online.[källa från Wikidata]