Kvalserien till Elitserien i ishockey 1999 spelades 24 mars-17 april1999 för att avgöra vilka lag som skulle få spela i Elitserien 1999/2000. Kvalserien bestod av sex lag och spelades i tio omgångar. Linköpings HC och Västerås IK tog platserna till Elitserien. Det innebar uppflyttning för Linköping medan Umeålaget Björklöven förlorade sin plats och fick spela i den nybildade Allsvenskan den följande säsongen