Kvalserien till Elitserien i innebandy 2006/2007 spelades den 5 mars till 2 april 2006 där tre lag från Division 1 samt ett lag från Elitserien (SSL) deltog. Laget från SSL blev Balrog B/S IK som fick möta IBF Älvstranden, Finspångs IBK och Umeå City IBK. De två främsta lagen gick upp i Elitserien 2006/2007.
Tabell
Nr = Placering, S = Spelade, V = Vinster, O = Oavgjorda, F = Förluster, ÖV = Övertidsvinster, GM - IM = Gjorda mål - Insläppta mål, MSK = Målskillnad, P = Poäng