John Harbaughs bror Jim Harbaugh är även han tränare i amerikansk fotboll. Jim Harbaugh är huvudtränare för Michigan Wolverines. De båda brödernas lag möttes i Super Bowl XLVII i februari 2013. Det var första gången ett brödrapar möttes som huvudansvariga för var sitt lag i Super Bowl. Bröderna Harbaugh är även det första brödraparet som lett varsitt lag i NFL.[2]
Under John Harbaughs fem år i ledningen för laget har Baltimore Ravens varje säsong nått slutspelet.
