I föreningens ungdom stod IK Sirius i skuggan av dåtidens bandysuveräner IFK Uppsala (12 SM-guld). IK Sirius hade sin storhetsperiod i bandy under 1960-talet (då 3 SM-guld vanns på 5 spelade finaler). En ny storhetsperiod syntes vara i vardande i början av 1990-talet, och bland annat värvades den från RSFSR bördige superstjärnan Sergej Lomanov. Den stora framgången uteblev emellertid, varpå grandiosa ekonomiska problem följde. Perioden från slutet av 1990-talet fram till mitten av 00-talet kännetecknades av dessa ekonomiska problem samt ett ständigt skiftande av serietillhörighet mellan Allsvenskan och Division I. Under ett par säsonger fick Sirius kämpa hårt om epitetet "bäst i Uppsala" med IF Vindhemspojkarna (en kamp som vid ett par tillfällen gick IK Sirius förlorad).
Mellan 2008 och 2011 hade föreningen ett uppsving med SM-slutspel och i semifinalen mot Edsbyn 2009 var det närmare 10 000 åskådare som följde jakten på en SM-final. Sirius spelar sina hemmamatcher på Studenternas IP. I oktober 2010 påbörjades bygget av en bandyhall (Relitahallen), endast avsedd för träning, som stod klar till säsongen 2011/12.
