Emilio Tuñón utbildade sig på Escuela Técnica Superior de Arquitectura de Madrid på Madrids tekniska universitet med examen 1981 och arbetade på Rafael Moneos arkitektkontor till 1992. År 1990 var han redaktör för tidskriften Arquitectura och grundade 1992 tillsammans med Luis M. Mansilla, arkitektkontoret Mansilla+Tuñón Arquitectos i Madrid.