Cherokesiska har tre större dialekter. Den södra dialekten dog ut runt år 1900. Den mellersta eller Kituhwadialekten talas av Eastern band i Quallaområdet. Overhilldialekten eller den västra dialekten talas i Oklahoma[2]. Den södra dialekten som talades av invånarna i Lower Towns i området runt gränsen mellan South Carolina och Georgia hade r som likvida, alltmedan den samtida Kituhwa- eller Ani-kituwahdialekten som talades i North Carolina och Overhill hade l. Därmed har det inhemska namnet på språket ett L i sig, tsalagi, medan det på svenska och engelska har ett R, cherokesiska.
Fonologi
Det cherokesiska språket har bara en enda labial konsonant, /m/, som dessutom är ett relativt nytt fonem. Cherokesiskans <w> är ibland labiovelart, men även då alltså inget rent labialt ljud.
Cherokesiska är ett tonspråk och använder toner som kan kombineras på olika sätt och följer subtila och invecklade regler som varierar beroende på var man är. Tonsystemet har gradvis genomgått en förenkling på många platser eftersom cherokesiska är ett andraspråk på många platser. Dock spelar tonerna fortfarande en viktig roll i ords betydelse och många använder dem fortfarande, framförallt äldre talare. Den cherokesiska stavelseskriften visar dock inte toner och det är ovanligt att man inte förstår på grund av att tonerna utelämnas. Inte heller transkriberad cherokesiska visar toner förutom i ordböcker. Modersmålstalande kan urskilja skillnaden mellan ord där endast tonen skiljer dem från varandra från sammanhanget.