Peroksidaza rena

Peroksidaza rena
Peroksidaza rena C1[1]
Identifikatori
Organizam	Armoracia rusticana
Simbol	Peroxidase C1A
Alt. simboli	PRXC1A
PDB	1W4W dodatne strukture
UniProt	P00433
Other data
EC broj	1.11.1.7

Enzim peroksidaza rena (HRP), prisutan u korenu rena, ekstenzivno se koristi u biohemiji, prvenstveno zbog njegove spososobnosti da pojača slab signal i da uveća detektabilnost ciljnih molekula. On je metaloenzim sa mnoštvom izoformi, od kojih je najbolje izučen tip C.

Struktura

Struktura enzima je prvi put rešena pomoću rendgenske kristalograpije 1997. godine.^[2] Od tog vremena je strukture rešena više puta sa različitim supstratima.^[3] Ovaj enzim je alfa heliksni protein koji vezuje hem kao redoks kofaktor.

Substrati

Sam HRP enzim, ili njegovi konjugati, su od male koristi. Njegovo prisustvo se mora učiniti vidljivim koristeći supstrat, koji nakon oksidacije posredstvom HRP koristeći vodonik peroksid kao oksidacioni agens proizvodi karakterističnu promenu, koja se može detektovati spektrofotometrijskim metodama.^[4][5]

Brojni supstrati za peroksidazu rena su poznati i komercijalno dostupni. Supstrati se dele u nekoliko kategorija. HRP katalizuje konverziju hromogenih supstrata (e.g., TMB, DAB, ABTS) u obojene produkte, i proizvodi svetlost kad deluje na hemiluminescentne supstrate (e.g. poboljšana hemiluminescencija pomoću luminola).

Neki od najčešće korištenih HRP hromogenskih supstrata, luminol je izuzetak u kome se fluorofor generiše nakon HRP-katalizovane reakcije.

Reference

1. PDB: 1w4w​; Carlsson GH, Nicholls P, Svistunenko D, Berglund GI, Hajdu J (2005). „Complexes of horseradish peroxidase with formate, acetate, and carbon monoxide”. Biochemistry. 44 (2): 635—42. PMID 15641789. doi:10.1021/bi0483211. 
2. PDB: 1ATJ​; Gajhede M, Schuller DJ, Henriksen A, Smith AT, Poulos TL (1997). „Crystal structure of horseradish peroxidase C at 2.15 A resolution”. Nature Structural Biology. 4 (12): 1032—8. PMID 9406554. doi:10.1038/nsb1297-1032. 
3. „Peroxidase C1A Related PDB sequences”. UniPDB. European Bioinformatics Institute. Архивирано из оригинала 13. 09. 2019. г. Приступљено 28. 11. 2016. 
4. Veitch NC (2004). „Horseradish peroxidase: a modern view of a classic enzyme”. Phytochemistry. 65 (3): 249—59. PMID 14751298. doi:10.1016/j.phytochem.2003.10.022. 
5. Akkara JA, Senecal KJ, Kaplan DL (1991). „Synthesis and characterization of polymers produced by horseradish peroxidase in dioxane”. Journal of Polymer Science. 29 (11): 1561—74. doi:10.1002/pola.1991.080291105. 

Spoljašnje veze

• Horseradish peroxidase на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)