PC-9 velja za močnejšo različico predhodnika v tej kategoriji letal, PC-7. Ohranja vse lastnosti svojega predhodnika, vendar ima zelo malo enakih konstrukcijskih lastnosti. Izmed vseh izboljšav ima PC-9 večjo in sodobnejšo kabino s katapultnima sedežema.
Program PC-9 se je uradno začel izvajati leta 1982. Čeprav so nekatere aerodinamične elemente začeli preizkušati na letalih PC-7 med letoma 1982 in 1983, je prvi prototip letala PC-9 vzletel 7. maja 1984. Drugi prototip je vzletel 20. julija istega leta. Ta prototip je že imel vso standardnoelektroniko in letalne inštrumente in je bil skoraj v popolnosti primerljiv s serijskimmodelom.
Model Pilatus PC-9M »Hudournik«, ki je bil predstavljen leta 1997, je bil izdelan kot plod sodelovanje Slovenske vojske in izraelskevojaške industrije in je narekoval nove standarde tega letala. Ima podaljšano hrbtno plavut letala, kar izboljša stabilnost letala, pod krili ima obešene nosilce za orožje, prav tako ima tudi nov motor. V pilotski kabini pa ima inštrumente prilagojene za bojne naloge. Ta model je že v samem začetku naletel na dober odziv: Slovenija je v decembru leta 1997 naročila 9 letal, januarja leta 1999 je Oman naročil 12 primerkov, 8. januarja pa 2003 je Irska podpisala pogodbo o dobavi 8 letal.
Nesreče letala
Letalo PC-9 je z le dvema nesrečama v svoji več kot 20-letni zgodovini zelo varno letalo.
Letalo PC-9M v lasti ciprskeNacionalne garde je strmoglavilo 10. septembra 2005 blizu vasi Kolossi na Cipru. Za zdaj vzroki nesreče še niso znani, letalo naj bi letelo okoli 80 km izven začrtane smeri in brezciljno krožilo, ter oplazilo zvonik lokalne cerkve.
Avstralija: 67 (dva sta bila narejena v tovarni Pilatus, 17 jih je bilo dostavljenih po delih in zgrajenih v tovarni Hawker de Havilland, ostalih 48 pa so izdelali sami prav tako v tej tovarni.)
Slovenija: 11 (3 dostavljeni leta 1995 (eden je bil izgubljen v nesreči leta 2004), 9 dostavljenih novembra 1998. Ti primerki so bili nadgrajeni v Izraelu.)