Brazílska účasť v kvalifikácii bola vďaka zmene pravidiel prvou účasťou aktuálneho majstra sveta v kvalifikácii na záverečný turnaj. To malo aj priamy dopad na organizáciu záverečného turnaja: od Majstrovstiev sveta 1990 súpermi v prvom zápase finálového turnaja boli vždy obhajca prvenstva a mužstvo zo skupiny, ktoré bolo určené žrebovaním šampionátu. (na MS 1990, Argentína, víťaz MS 1986, hrala s Kamerunom; na MS 1994, Nemecko, víťaz MS 1990 s Bolíviou; na MS 1998, Brazília so Škótskom a na MS 2002 hralo Francúzsko so Senegalom). Od Majstrovstiev sveta 2006, keď obhajca stratil výhodu automatického postupu na finálový turnaj, možnosť otvoriť turnaj pripadla na hostiteľskú krajinu (na MS 2006 hralo otvárací zápas Nemecko s Kostarikou). Brazília, hoci obhajca prvenstva, hrala až na štvrtý deň s Chorvátskom.
Národné mužstvo sa na záverečný turnaj kvalifikovalo ľahšie ako na predchádzajúce majstrovstvá; na MS 1994 sa Brazília kvalifikovala až v poslednom zápase proti Uruguaju, v ktorom by prehra znamenala vypadnutie; počas kvalifikácie na MS 2002 Brazília vystriedala až štyroch trénerov a istý čas bola v nepostupujúcej pozícii.
Kvalifikácia Majstrovstiev sveta 2006 mala rovnaký formát ako kvalifikácia predchádzajúceho šampionátu v rokoch 2000 a 2001: všetkých desať juhoamerických mužstiev hralo každý s každým dva zápasy, kde prvé štyri mužstvá automaticky postupovali na záverečný turnaj, kým piate hralo barážové stretnutie s víťazom oceánskej kvalifikácie, ktorým bolo mužstvo Austrálie.
Brazília skončila na prvom mieste s týmito výsledkami:
Mesiac pred začiatkom finálového turnaja brazílske národné mužstvo pricestovalo do malého švajčiarskeho mesta Weggis a ubytovalo sa v hoteli Weggis Park. Dôvodom bola aklimatizácia na podnebie, podobné nemeckému a sústredenie sa na šampionát. Príprava začala 22. mája a skončila sa 4. júna.
Počas prípravy Brazília odohrala dva priateľské zápasy. Prvý 28. mája proti brazílskemu klubovému mužstvu do 20 rokov Fluminense, ktoré bolo na turnaji v Európe pricestovalo do Švajčiarska odohrať zápas s národným mužstvom. Tento zápas skončil 13:1 v prospech národného mužstva. Druhý zápas hrali proti švajčiarskemu klubu z kantónu Lucerne, ktorý vyhral druhú švajčiarsku ligu. Zápas sa odohral v Berne a Brazília vyhrala 8:0.
Počas sústredenia vo Švajčiarsku Brazílska futbalová konfederácia predala práva na pokrytie pobytu národného mužstva vo Švajčiarsku. Za cenu 1,2 milióna amerických dolárov mohla švajčiarska firma predávať lístky na tréningy (lístok stál 40 EUR a na každom tréningu bola približne 5000 divákov) —, udeľovať povolenia na pobyt v tréningovej zóne a blízkom okolí (~2000 EUR + 10% zisk) – a organizovať priateľské zápasy počas prípravy národného mužstva.
31. mája, iba 13 dní pred prvým zápasom na šampionáte, bol zo súpisky vyškrtnutý obranca Edmilson kvôli zraneniu kolena, ktoré utŕžil deň predtým na tréningu. Namiesto neho bol povolaný hráč klubu São PauloMineiro.
Po opustení Weggisu, 4. júna, mužstvo pricestovalo do nemeckého mesta Königstein im Taunus, ktoré preinvestovalo 500 000 eur počas prípravy na príchod brazílskeho mužstva. V meste mužstvo odohralo jeden prípravný zápas proti Novému Zélandu, ktorý skončil 4:0.
Žreb
Už tradične bola hostiteľská krajina, ako prvá nasadená, vybratá do Skupiny A. Aby sa zabránilo možnému zápasu medzi Brazíliou a Nemeckom skôr ako vo finále, FIFA6. decembra 2005 umiestnila aktuálneho šampióna do Skupiny F. Súpermi Brazílie v základnej skupine boli mužstvá Chorvátska, Austrálie a Japonska.
História
Brazílske národné mužstvo sa Majstrovstách sveta so svojimi súpermi zo základnej skupiny nikdy nestretlo. Nasleduje história vzájomných zápasov mimo svetového šampionátu podľa [1]:
Súper
Zápasy
Víťazstvá
Remízy
Prehry
Strelené góly
Inkasované góly
Prvý zápas
Posledný zápas
Chorvátsko
1
0
1
0
1
1
1:1 (17. augusta 2005 na štadióne Poljud v Splite)
1:1 (17. augusta 2005 na štadióne Poljud v Splite)
Austrália
5
3
1
1
9
1
1:0 (7. júla 1988 na Melbourne Cricket Ground v Melbourne)
0:1 (9. júna 2001 na Munsu Cup Stadium, Ulsan, Kórejská republika)
Japonsko
7
5
2
0
16
3
1:0 (23. júla 1989 na Estádio São Januário, Rio de Janeiro)
2:2 (22. júna 2005 na RheinEnergieStadion, Kolín, Nemecko)