Salvador je konzervativan kada su u pitanju prava LGBT osoba. Početkom 21. veka, primećene su lagane promene. Istopolni odnosi su legalizovani 2006. godine, ukidanjem krivičnog zakonika iz 1982. godine koji ih je kriminalizovao. Nikada nije postojao zakon protiv ženske homoseksualnosti, a i postojeći zakon se duže vreme pre ukidanja nije primenjivao. Godine 2009. doneta je posebna zakonska regulativa koja je gejevima dozvolila otvoreno služenje vojnog roka. Ipak, transrodne osobe se i dalje ne mogu regrutovati, kao 'psihički nestabilne'. U Salvadoru je od 1994. godine dozvoljena zakonska terapija korekcije pola, iako su post-operativne transseksualne osobe često diskrimisane i odbacivane od strane svojih porodica. Jedna zvanična LGBT organizacija u Salvadoru, Rainbow Front, je osnovana još 2003. godine kada je homoseksualnost jos uvek bila ilegalna. Njeni istupi u javnosti su postali vidljivi tek posle legalizacije 2006. godine.
