Arhipelag Chagos je otkrio Vasco da Gama početkom 16. vijeka. U 18. vijeku polagala je pravo na njih Francuska, kao na posjed od Mauricijusa. Godine 1810. Mauricijus zauzima Ujedinjeno Kraljevstvo, a Francuska ga ustupa Pariškim sporazumom iz 1814. godine. Poljodjelski radnici su doselili na taj arhipelag krajem 19. vijeka, naselivši se na glavni otok Diego Garcia i napravivši plantažekopre. Danas su jedini stanovnici otoka pripadnici američke i britanske mornarice koji imaju bazu na otoku Diego Garcia.