С рождения Фридрих был слабым ребёнком, страдая от небольшого паралича в одной ноге. Его мать неоднократно пыталась убедить его принять монашескую клятву, отказавшись от прав наследования в пользу младших братьев.
Ранняя смерть старших братьев (Фридрих Август умер в 1721 году, а Иосиф Август в 1728 году) сделала его наследником престола. 5 октября 1763 года со смертью своего отца, Фридрих Кристиан стал курфюрстом Саксонии.
Он был открыт для идей эпохи Просвещения, а также обладал музыкальным талантом.
Одним из своих первых актов Фридрих отстранил от власти премьер-министра Брюля из-за его непопулярности. Она была вызвана не только неудачной экономической политикой, но и внешней, из-за которой Саксония была втянута в Семилетнюю войну.
Курфюрст занялся восстановлением финансовой системы Саксонии с помощью своих реформ. Ему удалось восстановить опустошённую войной страну, снизить расходы на судебную систему и упростить правительство по экономическим принципам.