Сезон 1946 года стал для ФК «Спартак» Москва 25-м в своей истории. В нем команда приняла участие в 8-м чемпионате страны и в 7-м розыгрыше кубка. По итогам чемпионата «Спартак» занял 6 место. В кубке удалось дойти до финала, где в дополнительное было обыграно тбилисское «Динамо». Этот завоеванный кубок СССР стал третьим в истории «Спартака».
В 1946 году приход на тренерский мостик эстонского специалиста Альберта Вольрата помог «Спартаку» стать крепким середняком чемпионата. Однако вернуть довоенные позиции в советском футболе красно-белым не удалось. Команда начала чемпионат неудачно, проиграв московским «армейцам» 2:5, крайне неудачно действовали защитники. Однако вскоре игра стала налаживаться и команда завершила первый круг на 5-м месте. Перед началом второго круга Вольрат поставил задачу команде занять 4-е место: «Рассчитываем занять четвёртое место. Тбилисское „Динамо“, „Торпедо“ и динамовцы Ленинграда — вот наши главные конкуренты». Однако в очных встречах с главными конкурентами «Спартак» проиграл, заняв по итогам чемпионата 6-е место, чемпионами СССР стали футболисты ЦДКА.
В финале «Спартак» встречался с тбилисским «Динамо», на 9-й минуте классная комбинация спартаковцев с участием Дементьева, Глазкова и Конова завершилась взятием ворот грузинской команды. Однако вскоре «динамовцы» уже вели в счете, но до перерыва красно-белым удалось отыграться — 2:2. Во втором тайме забитых мячей не было, лишь в дополнительное время точный удар Тимакова принес «спартаковцам» третий Кубок СССР в истории.