Точкой отсчёта в своей истории Таганрогский лицей считает 8 декабря1988 года, когда Решением № 411 исполнительного комитета Таганрогского городского Совета народных депутатов при Таганрогском радиотехническом институте был открыт «Специализированный класс с углубленным изучением информатики при Таганрогском радиотехническом институте и школе № 8».
На первых порах занятия лицея проводились в здании средней школы № 8, расположенной неподалёку от главных корпусов «Г» и «Д» радиотехнического института[2].
C 1 сентября 1991 года в соответствии с Приказом Ростовского областного управления народного образования № 707 от 19 августа 1991 года предусматривалось открытие областного технического лицея при ТРТИ на базе действующих специализированных классов с углубленным изучением информатики при ТРТИ, но, в связи с развалом СССР, приказ № 707 не был выполнен.
С 1 января 1992 года классы начали функционировать как Городской технический колледж при ТРТИ.
24 февраля 1995 года Постановлением № 543 Главы Администрации г. Таганрога образовательное учреждение зарегистрировано как «Таганрогский муниципальный общеобразовательный лицей при ТРТУ».
Высокий уровень лицейского преподавания привлёк внимание родителей и школьников Таганрога буквально с первых месяцев существования лицея. Приём детей осуществлялся на конкурсной основе[3]. В 1998 году конкурс при поступлении составлял 4,3 человека на место. В 1999 году он уже достигал 5,5 человек на место[3].
Система обучения в лицее была приближена к вузовской[1].В лицее было четыре основных класса и четыре контрактных[1]. Орехов вспоминал, что коммерческие «классы» были созданы для развития материально-технической базы лицея и для рекламы — чтобы город увидел, что можно сделать со школьниками за один год[1]. Известность лицея скоро вышла за рамки Таганрога: по учебному плану и авторским программам лицея стали обучать детей в лицейских классах в Туапсе, Ейске, Невинномысске, Новороссийске, Сальске, Волгодонске, Майкопе, Армавире и других городах[1].
На 1999 год в лицее преподавали 2 доктора наук, 20 кандидатов наук, 16 учителей высшей категории[3]. Причём работали они не в штате лицея, штатных работников было всего четыре[3]. При лицее работали подготовительные курсы, на которых обучалось около 250 человек[3].
В 2005 году лицей, по-прежнему находившийся в корпусе «А» ТРТУ ЮФУ, стал муниципальным и перестал официально быть при ТРТУ. С этого момента лицей носил название «Муниципальное общеобразовательное учреждение лицей г. Таганрога».
В апреле 2007 года, после многочисленных конфликтов с Управлением образования Таганрога, возглавляемым И. В. Голубевой, бесконечных проверок и ревизий, сооснователь и директор лицея Борис Иванович Орехов подал заявление об уходе, мотивируя своё решение состоянием здоровья[4]. В вину руководству лицея ставились 4 основных «нарушения»: конкурсный прием в лицей, авторские методики преподавания, 90 % совместителей, высокие зарплаты преподавателей[4]. Таким образом к категории нарушений были отнесены те базовые принципы, которые и отличали лицей от основной массы государственных учебных заведений. В мае 2007 года родители лицеистов обратились с открытым письмом к Губернатору Ростовской области В. Ф. Чубу и Главе администрации Таганрога Н. Д. Федянину с просьбой остановить разгром лицея и сохранить его в том формате, который и привлекал к нему все эти годы внимание учеников и родителей[4].
Однако администрация города и области не обратила внимание на это письмо[4]. Новым директором, несмотря на положение о необходимости согласования этой должности с коллективом лицея, закреплённой Уставом лицея, Управление образования Таганрога назначило И. А. Вырабову[4].
В ноябре 2013 года Лицей № 4 отметил двойной юбилей, 90-летие школы № 4 и 25-летие Таганрогского лицея при ТРТУ[10]. Представители администрации города отметили, что за 25 лет из стен лицея вышло 59 золотых медалистов и 108 серебряных, а на сегодняшний день лицей является в городе лидером по количеству побед в городских и региональных олимпиадах, его ученики успешно выступают на соревнованиях всероссийского и международного уровня[10].
Флаг лицея
Флаг лицея представлял собой полотнище, сшитое из маленьких разноцветных лоскутков ткани, на каждом из которых было написано имя одного из выпускников лицея[11]. Идея флага была предложена преподавателем английского языка Л. Д. Басовой. По установившейся традиции все ученики выпускных классов приносили в лицей «именные» лоскутки, которые подшивались к полотнищу, от выпуска к выпуску увеличивая его размеры.
Басов, Михаил Михайлович (1977) — преподаватель литературы, российский медиахудожник, режиссёр-документалист.
Нарушевич, Андрей Георгиевич (1971—2023) — преподаватель русского языка и литературы, кандидат филологических наук, автор многих научных и учебно-методических публикаций.
Цитаты
«В принципе, потенциал лицея городом не востребован. Надо бы организовать многопрофильный лицей с тремя основными направлениями: физико-математическим, химико-биологическим и гуманитарным. У нас для этого всё есть, мы готовы. Нужно только помещение в центре, потому что едут к нам ребята со всех городских районов. Здесь мы стеснены в площадях. Уже лет пять вместе с ректоратом ТРТУ пробуем решить эту проблему, но пока не получается. Наши надежды на будущее связаны с тем, что к следующему десятилетию лицея достаточно большое количество наших выпускников займёт ведущее положение в городе»[3] — Б. И. Орехов, 1999.