Хуан Карлос Муньос был воспитанником клуба «Индепендьенте», за которую выступал за 4-й состав команды[2]. Он начал карьеру в клубе «Спортиво Док Суд» в 1938 году[2]. Этому клубу он помог выйти в Примеру аргентинского дивизиона, сыграв в 23 матчах и забив 13 голов. В Примере он провёл за Док Суд 4 игры в которых забил 4 гола[3]
В июне 1939 года Муньос перешёл в клуб «Ривер Плейт» за 400 песо, которые заплатил президент «Ривера», Антонио Либерти, увидевший Муньоса в составе «Док Суд»[2]. Его дебютной игрой стал матч 15 октября 1939 года против «Атланты», завершившийся победой «Ривера» 4:2[3]. В «Ривере» Муньос первоначально соперничал за место в составе с Деамброси, но затем вытеснил его из состава и стал заменой завершившему карьеру Карлосу Пеуселье[2]. Он выступал за команду на протяжении 11-ти сезонов, сыграв в 184 матчах и забив 39 голов[2]. Муньос был часть знаменитой «Машины» (La Máquina), которая доминировала в аргентинском футболу в 1940-х годах, выиграв 4 титула чемпионата Аргентины. При этом Муньос, как и Лоустау слева, являлся «разгоняющим», благодаря своей скорости и физической выносливости, атаки команды по флангу[4] Завершил карьеру Муньос в клубе «Платенсе», за который сыграл за 3 сезона 39 матчей и забил 3 гола[2]. Его место в составе занял Сантьяго Вернасса[3].
После завершения игровой карьеры, Муньос остался в «Платенсе» на должности менеджера, а затем президента клуба. Также он работал футбольным экспертом в реадиопрограмме «Los Ases del Deporte» (Эксперты Спорта), которая объединяла нескольких завершивших карьеру игроков, рассуждающих о футболе[3]. Недолго проработал Муньос футбольным экспертом на телевидении[3]. Последние годы жизни Муньос прожил с кардиостимулятором. Он умер в 2009 году от инфаркта миокарда[5]. «Ривер» почтил память Муньоса минутой молчания[6].
.svg){kind=small}
