Родился в городе Лерма провинции Бургос6 января1845 года. С 1860 года — в Ордене иезуитов, в 1875 году стал профессором физико-химических и естественных наук. Ездил в Гавану, где преподавал риторику в течение трёх лет, затем учился теологии в Вудстокском колледже[англ.] в Мэриленде и в семинарии Пуэрто-Рико.
С 1887 года Мерино руководил метеорологической обсерваторией на реке Миньо, издал несколько публикаций по метеорологии, в частности, по штормам близ западного берега Галисии. С 1890 года занимался ботаническими исследованиями галисийской флоры. В 1897 году Мерино выпустил Contribución á la flora de Galicia, впоследствии неоднократно им дополнявшуюся. В 1898 году он издал региональную монографию рода Ромулея. С 1905 по 1909 выходила трёхтомная работа Flora descriptiva é ilustrada de Galicia, составленная Бальтасаром Мерино.
