В феврале 1992 года Посольство Японии в Литве было создано в Дании, а в январе 1997 года перемещено в Вильнюс. В июне 1998 года в Токио было создано Посольство Литвы в Японии[1].
Послом Японии в Литве является Сиро Ямасаки[2], послом Литвы в Японии — Гедиминас Варвуолис[3].
3 января 1919 года, дата когда Япония де-факто признала Литву[4], считается началом двусторонних отношений. 5 февраля 1929 года между Японией и Литвой было подписано соглашение, предусматривающее отмену виз, а в 1930 году было подписано соглашение «О торговле и снабжению». 23 ноября 1939 года было создано консульство Японии, которое возглавлял вице-консул Тиуне Сугихара.
В течение Второй мировой войны, в 1940 году, Сугихара помог бегству еврейских беженцев, выдав им транзитные визы в Каунасе[5]. Cугихара на тот момент был вице-консулом японской дипломатической миссии и проигнорировал инструкции правительства Японии относительно выдачи транзитных разрешений в Японию еврейским семьям, которые бежали из Польши в разгар захвата её нацистами. В результате этого поступка было спасено до 10 тыс. беженцев[6].
Современные отношения
Существует значительное и сильное партнёрство между городами Кудзи и Клайпеда, начатое в 1989 году[7].
Япония признала Литву 6 сентября 1991 года, через месяц были восстановлены дипломатические отношения между этими странами. В 1997 году в Вильнюсе было создано посольство Японии, а в 1998 году в Токио — посольство Литвы.
В 2007 году император и императрица Японии Акихито и Митико совершили официальный визит в Литву[8][9].
В 2016 году Япония и Литва согласились на сотрудничество в области ядерной безопасности[10][11].