Сельсовет, как Монайский, в составе Ак-Шеихского района (переименованного в 1944 году в Раздольненский[17]) был образован в 1930-х годах, поскольку на 1940 год он уже существовал[18]. Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 21 августа 1945 года Монайский сельсовет был переименован в Ковыльновский сельский совет[19]. С 25 июня 1946 года совет в составе Крымской области РСФСР[20], а 26 апреля 1954 года Крымская область была передана из состава РСФСР в состав УССР[21]. На 15 июня 1960 года в составе совета числились населённые пункты[22]:
Указом Президиума Верховного Совета УССР «Об укрупнении сельских районов Крымской области», от 30 декабря 1962 года Раздольненский район упразднили и совет присоединили к Черноморскому[23][24]. 1 января 1965 года, указом Президиума ВС УССР «О внесении изменений в административное районирование УССР — по Крымской области», вновь включили в состав Раздольненского[25].
В январе 1967 года был образован Ботанический сельский совет, в который отошли Борисовка, Ботаническое (ранее Степное), Кумово и Присивашное; к 1 января 1968 года ликвидированы Кремнево, Ласточкино, Малютка, Пограничное, Татьяновка и Тюльпаны — совет обрёл современный состав[26].
С 12 февраля 1991 года сельсовет в восстановленной Крымской АССР[27], 26 февраля 1992 года переименованной в Автономную Республику Крым[28]. С 21 марта 2014 года в составе Крыма аннексировано Россией[29]. Законом «Об установлении границ муниципальных образований и статусе муниципальных образований в Республике Крым» от 4 июня 2014 года территория административной единицы была объявлена муниципальным образованием со статусом сельского поселения[30].
↑Справочник административно-территориального деления Крымской области на 15 июня 1960 года / П. Синельников. — Исполком Крымского областного совета депутатов трудящихся. — Симферополь: Крымиздат, 1960. — С. 41. — 5000 экз.
↑Гржибовская, 1999, Из Указа Президиума Верховного Совета Украинской ССР О внесении изменений в административное районирование Украинской ССР по Крымской области, с. 442.
↑Гржибовская, 1999, Указ Президиума ВС УССР «О внесении изменений в административное районирование УССР — по Крымской области», от 1 января 1965 года. Стр. 443.
Ковыльновский сельсовет // Города и села Украины. Автономная Республика Крым. Город Севастополь. Историко-краеведческие очерки. — Слава Севастополя, 2009.