Хосе Касерес начинал свою карьеру футболиста, выступая за скромные парагвайские клубы «Индепендьенте», «Ресистенсия» и «Сильвио Петтиросси». 2008 год он провёл за колумбийскую команду «Депортес Толима». С начала 2009 по середину 2012 года Касерес представлял парагвайский «Спортиво Триниденсе», после чего перешёл в асунсьонский «Насьональ». С последним он стал чемпионом страны и дошёл до финала Кубка Либертадорес в 2014 году.
В январе 2015 года парагваец стал футболистом чилийского «Коло-Коло». 8 апреля того же года он забил свой первый гол в рамках Кубка Либертадорес, отметившись в самой концовке гостевого поединка против мексиканского «Атласа»[3]. В январе 2016 года Касерес перешёл в парагвайский «Серро Портеньо».
.svg){kind=small}
