В 1833 году, овдовев, поступил в Киевскую духовную академию и 7 апреля того же года принял монашеский постриг с именем Иоасаф. По окончании курса в Академии, 7 сентября 1837 года был назначен инспектором и учителем в Астраханскую духовную семинарию. 15 декабря того же года возведён в степень магистра богословия и переименован в профессора, назначен цензором проповедей и 12 марта 1838 года получил в управление астраханский Иоанно-Предтеченский монастырь. В короткое время он привлёк в монастырь много жертвователей и украсил монастырь, продолжая в то же время службу в семинарии[5].
24 сентября 1845 года Святейшим Синодом уволен от духовно-училищной службы «за допущение неприличных званию его поступков, состоявших в хождении по городу Твери в неприличном для монашеского сана одеянии, употреблении в частных домах при сторонних людях мясной пищи, позднем возвращении в свою квартиру, находившуюся в семинарии, и ночевание иногда вне семинарии». Кроме того, иеромонаху Иоасафу инкриминировалось также выступление с проповедью, в которой не были учтены исправления, сделанные в ее тексте цензором. Сослан в Спасо-Евфимиев монастырь в Суздале, служивший в то время тюрьмой для лиц, совершивших преступления по церковной части. Заключённым он не был, ему даже разрешалось поначалу совершать церковные службы. Однако общение опального иеромонаха с узниками Спасо-Евфимиева монастыря вызвало недовольство епархиальных властей. Ему запретили служить в церкви, получать бумагу и чернила, над ним нависла угроза тюремного заключения[6].
В Суздале он занялся местной церковной историей. По материалам монастырского архива написал четыре очерка о жизни суздальских святых и чудотворцев. В 1853 году закончил труд «Церковно-историческое и статистическое описание Владимирской епархии» в 2-х томах. Очерки и двухтомный труд не были опубликованы.
В мае 1854 года епископ Иустин переместил его в Боголюбовский монастырь. Здесь иеромонах пользовался большей свободой, продолжал исследовать историю местных церквей и монастырей а также историю владимирского края. Публиковался в «Владимирских Губернских Ведомостях», «Записках юрьевского общества сельского хозяйства», в «Сыне Отечества» и в «Страннике».
Скончался 20 июля 1861 года предположительно в Боголюбском Алексеевском монастыре в Добром, где и был похоронен[7][8]. Старинная плита с надгробия иеромонаха Иоасафа была обнаружена 21 мая 2021 года от Царе-Константиновского храма — видимо, на этом кладбище погребались насельники Боголюбской Алексеевской обители. Новый памятник был воссоздан по благословению митрополита Тихона (Емельянова) трудами братии обители. 16 октября 2024 года в Боголюбском Алексиевском мужском монастыре г. Владимира митрополит Владимирский и Суздальский Тихон (Емельянов) совершил чин освящения нового надгробного памятника иеромонаху Иоасафу (Гапонову) в сослужении духовенства обители[9].
Поучительные слова на пять воскресных дней св. великой четыредесятницы, из церковной песни задостойника : «О тебе радуется». — Санкт-Петербург : В Тип. духовнаго журн. «Странник», 1861. — 44 с.
Слово в день Рождества Христова и беседа о красном пасхальном яйце. Для русскаго православнаго народа. — Санкт-Петербург : в Тип. дух. журнала «Странник», 1861. — 35 с.
Церковно-историческое и статистическое описание Владимирской епархии, составленное на основании определения Св. Правительствующего Синода от 19 мая/6 октября 1850 года / изд. подгот.: А. И. Раздорский, А. В. Сиренов. — Санкт-Петербург : Дмитрий Буланин, 2019. — 557 с. — 300 экз. — ISBN 978-5-86007-923-6
Уроженцы и деятели Владимирской губернии, получившие известность на различных поприщах общественной пользы / Собр. и дополнил А. В. Смирнов. Вып. 3. — Владимир, 1896. — С. 133—154.
Раздорский A. И. Церковно-историческое и статистическое описание Владимирской епархии 1853 г. иеромонаха Иоасафа (В. С. Гапонова) // Уваровские чтения-5. — Муром, 2003. — С. 161—169
