Зидов занимался изучением главным образом ржавчинных и головнёвых грибов, однако также интересовался флорой мхов и различными аскомицетами. В соавторстве со своим сыном Хансом (1879—1946) был автором многочисленных микологических монографий.
Основной гербарий Пауля Зидова был объединён с гербарием его сына и в 1919 году приобретён Шведским музеем естественной истории в Стокгольме (S). Зидов издал несколько серий эксикатов, среди которых выделяется Mycotheca marchica, вышедшая с 1880 по 1899 в 49 частях.
