Супруга — Констанса Энрикес де Кастилия, внебрачная дочь короля Кастилии Энрике II и сеньоры де Альба-де-Тормес. Ему наследовала его дочь от второго брака:
В 1465 годукороль КастилииЭнрике IV восстановил герцогский титул для Хуана де Акуньи и Португаля, 3-го графа де Валенсия-де-Дон-Хуан (правнука инфанта Жуана Португальского). Во время Войны за кастильское наследство Хуан де Акунья и Португаль находился на стороне Хуаны Бельтранехи, дочери короля Энрике IV, против сестры последнего, инфанты Изабеллы. В 1475 году замок Валенсия-де-Дон-Хуан был осажден и захвачен сторонниками Изабеллы Католички. Во время штурма замка дон Хуан де Акунья и Португаль погиб. После его смерти герцогский титул прекратил своё существование.