Осенью 1930 года в Московской сельскохозяйственной академии имени К. А. Тимирязева был объявлен конкурс на вакантные должности профессора коллоидной химии и доцента физической химии. По конкурсу заведующим кафедры физической химии был избран профессор Е. Н. Гапон[5].
Около 40 научных работ Е. Н. Гапона и его коллег посвящены вопросам физикохимии почв. В качестве развития направления в почвоведении и агрономической химии академика К. К. Гедройца и Г. Вигнера были изучены закономерности обмена катионов и анионов в почвах, почвенная кислотность, различные виды поглотительной способности почв и дана классификация видов поглотительной способности почв. Кроме того, он является разработчиком методов определения обменной и гидролитической кислотности почв, им были исследованы адсорбционные свойства алюмосиликатов и, в частности, изучен вопрос об алюмосиликатах как слабых ацидоидах[5].
Автор 167 научных трудов, а также учебных пособий по неорганической химии для медиков (1932), физколлоидной химии для медиков (1932), физической и коллоидной химии[2]. Некоторые публикации:
Гапон Е. Н., Иваненко Д. Д. Альфа-частицы в лёгких ядрах. ДАН СССР, Новая Серия, т.4, 1943. — С. 275—277.
Гапон Е. Н., Гапон Т. Б. Хроматографический метод разделения ионов / Сборник статей под ред. Е. Н. Гапона, Издатинлит, 1949.
В качестве редактора:
Каблуков И. А. Физическая и коллоидная химия / под ред. проф. Е. Н. Гапона. 4-е изд., испр. и доп. М.: Гос. изд-во сельскохозяйственной литературы, 16-я тип. Главполиграфиздата, 1949. — 464 с.
↑Герштейн С. С..На заре ядерной физики (неопр.). Природа № 8 (2004). Дата обращения: 3 августа 2014. Архивировано 10 августа 2014 года. со ссылкой на: Gapon E.N., Iwanenko D. // Naturwiss. 1932. Bd.29. S.792.
↑ 12Архивированная копия (неопр.). Дата обращения: 3 августа 2014. Архивировано из оригинала 11 августа 2014 года.Архивированная копия (неопр.). Дата обращения: 3 августа 2014. Архивировано 11 августа 2014 года.
Сторінки історії кафедри медичної та біоорганічної хімії Харківського національного медичного університету/ під редакцією Г. О. Сирової. — Харків: ТОВ «ЕДЕНА». — 2010. — 164 с.
Мчедлов-Петросян Н. О. Евгений Никитич Гапон // Вестник Харьковского национального университета. 2000. № 477. Химия. Выпуск 5 (28). — С. 163—164.
Давыдов А. Т. Роль Е. Н. Гапона в развитии физической химии. // Из истории отечественной химии. Харьков: Издательство ХГУ, 1952. — С. 186—197.
Фрост А. В. Евгений Никитич Гапон (1904—1950). Некролог // Успехи химии, 1950, 19, вып. 3. — С. 389—392.
Поляков Ю. Памяти Евгения Никитича Гапона (1904—1950) // Коллоидный журнал, 1950, 12, вып. 3. — С. 240.
Сушецкая Д. А. Гапон Евгений Никитич (1904—1950) // Межфакультетская конференция: Тезисы V студенческой конференции, посвящённой 110-й годовщине со дня рождения Е. М. Гапона. — Харьков: ХНМУ, 2014. — С. 12.