Участник Гражданской войны с 1918 года по 1921 год. В 1926 году участник разоружения бандформирований в Дагестане. В 1940 году начальник 8-го отдела АБТУ, на октябрь 1940 года начальник 3-го отдела Бронетанкового управления Автобронетанкового управления[2].
С января 1943 года по 17 августа 1944 года начальник Бронетанкового управления Главного бронетанкового управления[2].
21 августа 1943 года Афонину было присвоено воинское звание- генерал-майор инженерно-танковой службы. Принимал участие в создании малого плавающего танка Т-40, также был активным участником производства танка Т-60[1].
Принимал участие в работах по улучшению качества танков. Также наладил производство нового танка ИС-1[1].
