Родился в 1952 году в Новосибирске. В 1975 году окончил гуманитарный факультет Новосибирского государственного университета. Работал в вузах Новосибирска и Тюмени (ассистент кафедры общего языкознания Тюменского государственного университета, 1975—1976). С 1985 года в аспирантуре Института русского языка АН СССР (научный руководитель чл.-корр. АН СССР О. Н. Трубачев). В 1984 году в ИРЯ АН СССР защитил кандидатскую диссертацию на тему: «Опыт семантического анализа омонимов на праславянском фоне». С 1985 по 1990 работал в Институте истории, филологии и философии АН СССР (Новосибирск), был редактором томов Серии «Памятники фольклора народов Сибири и Дальнего Востока».
А. Е. Аникин — крупный специалист в области этимологии русской лексики, контактов русского языка и языков Сибири. Им созданы словари: «Этимологический словарь русских диалектов Сибири (заимствования из уральских, алтайских и палеоазиатских языков)» (2 издания: 1997, дополненное и уточненное — 2000) и «Этимологический словарь русских заимствований в языках Сибири» (2003). В настоящее время работает над «Русским этимологическим словарем» (совместный проект ИФ СО РАН и ИРЯ РАН).
Административные обязанности:
заведующий Сектором русского языка Института филологии СО РАН (Новосибирск);
член бюро Объединенного ученого совета по гуманитарным наукам СО РАН (Новосибирск);
руководитель гуманитарной секции Научно-издательского совета СО РАН (Новосибирск);
член диссертационного совета при Институте филологии СО РАН (Новосибирск);
член редколлегии «Сибирского филологического журнала» (Новосибирск);
член главной редколлегии серии «Памятники фольклора Сибири и Дальнего Востока» (Новосибирск).
А. Е. Аникин также является видным литературоведом, в основном как исследователь творчества И. Ф. Анненского и А. А. Ахматовой. В 1992 г. он участвовал в работе международного семинара по И. Ф. Анненскому в Париже, а в 2005 г. выступил с докладом на Международных юбилейных Анненских Чтениях в Москве.
Основные работы
Аникин А. Е. Этимологический словарь русских диалектов Сибири: Заимствования из уральских, алтайских и палеоазиатских языков / Рец.: канд. филол. наук Б. В. Болдырев, канд. филол. наук А. М. Певнов, д-р филол. наук Е. А. Хелимский; Институт филологии СО РАН. — Новосибирск: Наука. Сибирское предприятие РАН, 1997. — 776 с. — 490 экз. — ISBN 5-02-031031-X.
Аникин А. Е. Этимологический словарь русских диалектов Сибири: Заимствования из уральских, алтайских и палеоазиатских языков / Ин-т филологии СО РАН. — 2-е изд., испр. и доп. — М., Новосибирск: Наука, 2000. — 768 с. — ISBN 5-02-031804-3.
Аникин А. Е. Этимологический словарь русских заимствований в языках Сибири / Ин-т филологии. — Новосибирск: Наука, 2003. — 788 с. — 800 экз. — ISBN 5-02-031852-3.
Опыт словаря лексических балтизмов в русском языке. Новосибирск: Наука, 2005.
Аникин А. Е.Иннокентий Анненский и его отражения: Материалы. Статьи. — М.: Языки славянских культур, 2011. — 472 с. — (Studia poetica). — 500 экз. — ISBN 978-5-9551-0472-0.
Вып. 12 (грак I — дбать). — М.: ИРЯ РАН; Новосибирск: ИФ СО РАН; СПб.: Нестор-История, 2018. — 376 с. ISBN 978-5-4469-1372-5.
Вып. 13 (два — дигло). — М.: Ин-т рус. яз. им. В. В. Виноградова РАН; Ин-т филологии Сибирского отделения РАН, 2019. — 376 с. ISBN 978-5-88744-087-3.
Вып. 14 (дигнитарь — дрощи). — СПб.: Нестор-История, 2020. — 384 с. ISBN 978-5-4469-1761-7.
Вып. 15 (друг I — еренга). — СПб.: Нестор-История, 2020. — 384 с. ISBN 978-5-4469-2005-1.
Вып. 16: (ерепениться — житьё). — М.: Ин-т рус. яз. им. В. В. Виноградова РАН; Ин-т филологии Сибирского отделения РАН, 2022. — 389 с. ISBN 978-5-7164-1213-2.
Вып. 17: (жихарь I — засьюндывать). — М.: Ин-т рус. яз. им. В. В. Виноградова РАН; Ин-т филологии Сибирского отделения РАН, 2023. — 391 с. ISBN 978-5-7164-1303-0.
