В сентябре 1812 года примкнул к партизанскому отряду Д.В. Давыдова и во время Отечественной войны 1812 года успешно действовал на коммуникациях противника. 21 декабря 1812 года произведён в подполковники.
23 марта 1813 года участвовал в занятии Дрездена. 17 апреля 1813 года произведен в полковники. Прославился в октябре 1813 года при преследовании отступавших от Лейпцига французских войск. За отличия в боях при Бутштедте, Андисебене, Готе и Майнце, во время которых захватил сотни пленных, награждён орденом Святого Георгия 4-го класса.
27 марта 1814 года назначен командиром 3-го Украинского казачьего полка, был в должности до 8 октября 1817 года.
22 ноября 1817 года назначен командиром 1-го Бугского уланского полка. С 6 мая 1818 года — командир 2-й бригады Бугской уланской дивизии.
12 декабря 1819 года произведён в генерал-майоры. В 1821-1826 годах исправлял должность бригадного командира поселений эскадронов 3-й кирасирской дивизии. С 29 января по 18 сентября 1826 года — командир 1-й бригады 3-й кирасирской дивизии, после чего состоял по кавалерии и находился в отпуске для лечения. 5 декабря 1833 года вышел в отставку с мундиром и пенсией полного оклада.
Жил в своем имении в селе Городище Юхновского уезда Смоленской губернии. Четыре раза был депутатом дворянского собрания. В последние годы писал воспоминания[3][4]
По воспоминаниям Д.В. Давыдова[5], Храповицкий был
ума делового и весёлого, характера вспыльчивого, человек возвышенных чувств, строжайших правил честности, исполненный дарований как для поля сражения, так и для кабинета; образованности европейской.
Семьи не имел, жил один. Родовое имение унаследовал его внучатый племянник, Александр Сергеевич Храповицкий (внук его брата Ясона Семёновича Храповицкого).
↑Назарян Е. А. «Исполненный дарований, как для поля сражения, так и для кабинета…» герой Отечественной войны 1812 года С. С. Храповицкий. // Военно-исторический журнал. — 2016. — № 10. — С.71—74.
↑Русские портреты XVIII — начала XX вв.: материалы по иконографии. Вып. III. / Ком. по рус. иконографии; [сост. С.А. Подстаницкий ]. — Москва: Аватар, 2014. — 260 с.: ил. — ISBN 978-5-903781-09-6. C. 69-71.
↑Русские портреты XVIII — начала XX вв.: материалы по иконографии. Вып. X. / Ком. по рус. иконографии; [сост. С.А. Подстаницкий ]. — Москва: Фонд «Русские Витязи», 2021. — 256 с.: ил. — ISBN 978-5-907245-60-0. C. 126-127.
↑Давыдов Д.В. Дневник партизанских действий 1812 года. // Давыдов Д.В. Военные записки. Москва, 1940. С. 213-350.
↑Придворный месяцеслов на лето от Рождества Христова 1810. Санкт-Петербург, 1810. С. 501.
↑Придворный месяцеслов на лето от Рождества Христова 1824. Часть III. Санкт-Петербург, 1824. С. 97.
↑Список кавалерам императорских российских орденов всех наименований за 1832. Часть II. Санкт-Петербург, 1833. С. 8.
↑Список кавалерам императорских российских орденов всех наименований за 1832. Часть III. Санкт-Петербург, 1833. С. 30.