Шон Хоркофф начинал свою карьеру в команде Университета штата Мичиган в 1996 году. В своём первом сезоне в CCHA он был включён в сборную лучших новичков лиги.[1] В следующем сезоне Хоркофф улучшил свои показатели при том, что провёл меньше игр. После двух успешных сезонов в студенческой команде в 1998 году выставил свою кандидатуру на драфт НХЛ, где был выбран под 99-м номером клубом «Эдмонтон Ойлерз».
В сезоне 1999/2000 установил личный рекорд по голам, передачам и очкам за свою студенческую карьеру, во второй раз попал в сборную всех звёзд лиги, был назван лучшим игроком лиги.[2] Номинировался на «Хоби Бейкер Авард» — награду, вручаемую лучшему хоккеисту среди студентов.[3]
В университете Хоркофф изучал финансы и математику. Перед тем как стать профессиональным хоккеистом, он получил учёную степень.[4]
НХЛ
Шон Хоркофф в составе «Эдмонтон Ойлерз» в 2009 году
Сезон 2000/2001 Шон Хоркофф начал в фарм-клубе «Эдмонтона» «Гамильтон Булдогс», выступающем в АХЛ. В ноябре 2000 года стал новичком месяца в АХЛ.[5]4 декабря 2000 года «Эдмонтон» заявил Хоркоффа для участия в НХЛ. 13 декабря 2000 года в матче против «Даллас Старз» он забил свой первый в НХЛ гол. Остаток сезона он доиграл уже в НХЛ, принял участие в 5 играх плей-офф.[6]
В сезоне 2005/2006 «Эдмонтон» вышел в финал Кубка Стэнли, где в 7 матчах уступил «Каролине Харрикейнз». В плей-офф Хоркофф набрал 19 очков (7 голов и 12 передач).
В июле 2006 года Хоркофф подписал с «Эдмонтоном» трёхлетний контракт.
16 июля2008 года Хоркофф подписал с «Эдмонтоном» шестилетний контракт на сумму 33 миллиона долларов.[9]