Завод был создан по постановлению Совета министров СССР от 18 марта 1959 года. Дата начала строительства производственных площадей — 13 апреля 1959 года. Новое предприятие возглавил Г. П. Киселёв[источник не указан 1577 дней].
В 1990-е годы за счёт собственных средств завод принял участие в более 30 конверсионных программах, освоил выпуск около 50 новых наименований продукции гражданского назначения[источник не указан 1580 дней].
В 2007 году Томский приборный завод как юридическое лицо прекратил своё существование. Занимающее часть его бывших площадей закрытое акционерное общество с тем же названием его официальным правопреемником не является. Помимо этого, на бывшей заводской территории располагаются бизнес-инкубатор и другие организации[1].