В 1976 году окончил богословский факультет Скопского университета и трудился в Македонской архиепископии. Позднее окончил аспирантуру в Риме и преподавал в качестве профессора в Скопском университете.
20 сентября 1981 года в церкви святого Димитрия в Скопье был хиротонисан в сан епископа и возведён в достоинство митрополита Австралийского и Новозеландского, а 21 сентября 1981 года назначен администратором Дебарской и Кической митрополии.
Австралийской митрополией управлял до 1995 года, когда был назначен правящим архиереем Дебарской и Кической митрополии[2].
Также дважды был администратором Повардарской митрополии: с 1997 года до 13 февраля 2000 года, и с 5 июля 2002 года до 1 октября 2006 года[3].
В августе 2006 года в эфире радио «Свободная Европа» выступил за возобновление диалога с Сербской православной церковью о статусе православия в Республике Македонии при возможном посредничестве Русской православной церкви: «Считаю, что все открытые вопросы и проблемы решаются только посредством диалога» между МПЦ и СПЦ. Целью переговоров митрополит Тимофей назвал поиск «решения, которое удовлетворяло бы истине и справедливости, в то же время не отступая от векового национального права македонского народа». По его словам спорный вопрос о названии Церкви в Руспублике Маукедония быть решён при помощи двойного наименования «Македонская православная церковь — Охридская архиепископия», причём Церкви «греческого блока», которым «претит имя „Македонская“», могли бы употреблять вторую часть этого наименования. Вместе с тем митрополит Тимофей обвинил Сербскую церковь и сербское государство в осуществлении «единой стратегии, направленной на поддержку „квазицеркви“» во главе с «клириком СПЦ» Иоанном (Вранишковским), который, по мнению митрополита, «совершил серьёзное предательство македонского народа»[4].