Сфингомиелин представляет собой единственный фосфолипидчеловека, основа которого не включает глицериновый остаток. Сфингомиелин состоит из сфингозина, соединённого сложноэфирной связью с полярной группой. Полярная группа может быть представлена фосфохолином или фосфоэтаноламином. Ко второму углероду сфингозина за счёт амидной связи присоединена жирная кислота.