Субфоссилии, или субфоссильные остатки, — фоссилии, не достигшие полной фоссилизации (то есть окаменения). Часто речь идет об остатках животных, у которых сохранился не только скелет, но и слабо изменённые мягкие ткани. Субфоссильно могут сохраняться растительные и животные остатки. В первом случае остатки могут частично или полностью сохранять клеточную структуру. Термин употребляется главным образом в палеонтологии.
Растительные субфоссилии называются фитолеймами[1].
Субфоссилий находят в вечной мерзлоте, янтаре и болотах.
Экспозиция «Формы сохранности органических остатков»(рус.). Сайт Палеонтолого-стратиграфический музей кафедры динамической и исторической геологии Санкт-Петербургского государственного университета. Дата обращения: 10 февраля 2012. Архивировано 18 мая 2012 года.