В сезонах 2020 и 2021 годов участвовал в чемпионате Москвы (Дивизион «А») в рамках первенства России (III дивизион), а также Кубке Москвы среди ЛФК. 3 марта 2021 года «Сахалинец» стал победителем Зимнего кубка Президента МФФ, победив «Росич» со счётом 6:1[6].
29 мая 2022 года «Сахалинец» прошёл лицензирование для выступлений во Втором дивизионе ФНЛ, таким образом, получив статус профессионального клуба[7].
Сезон-2022/23 во Второй лиге клуб начал с двух побед в Москве (над «Родиной-2» — 2:0 и «Пересветом» — 3:0, 16 и 24 июля). 30 июля в 3-м туре в Рязани проиграл одноимённому клубу (1:2). Владелец «Сахалинца» Михаил Литвин, заявленный в этом матче также как игрок, находясь на скамейке запасных, на 60-й минуте[8] получил красную карточку за нецензурную брань, когда был недоволен перебитием отражённого вратарём «Сахалинца» одиннадцатиметрового удара[9]. После матча Литвин ударил двумя кулаками судью матча Станислава Исаева[10] и после вызова полицией следственной группы скрылся через чёрный ход[11][12]. На заседании контрольно-дисциплинарного комитета РФС (на которое Литвин был приглашён, но не явился) было принято решение дисквалифицировать Литвина на 1,5 года во всех соревнованиях под эгидой РФС и оштрафовать на 300 000 рублей за оскорбительное поведение и оказание физического воздействия на главного арбитра матча[10]. Экспертно-судейской комиссией при президенте РФС был вынесен вердикт об ошибочности назначения пенальти (в единоборстве за верховой мяч, закончившемся столкновением, вратарь команды «Сахалинец» первым сыграл в мяч рукой, судья должен был назначить штрафной удар в пользу «Сахалинца»)[13], при этом, по мнению автора telegram-канала «Алё, реф», решение перебивать одиннадцатиметровый было верным, так как вратарь сделал пару шагов с линии[12].
6 августа 2022 года в поединке первенства «Сахалинец» потерпел самое крупное поражение в истории (1:7) от клуба «Авангард» (Курск)[14]. 17 августа 2022 года «Сахалинец» дебютировал в Кубке России — в матче с «Балашихой» одержал победу со счётом 1:0[15].
В конце октября 2022 года было объявлено о создании медийной команды для участия в третьем сезоне Медийной футбольной лиги с сохранением команды во Второй лиге и возможностью игроков, по согласованию с тренером, играть как во Второй лиге, так и в Медиалиге[16]. В 2023 году, помимо в второй лиги, клуб принимал участие в третьем и четвёртом сезонах Медиалиги[17][18].
3 июня 2024 года Михаил Литвин заявил, что создаёт новую футбольную команду Lit Energy для участия в Медийной футбольной лиге. О проекте «Сахалинец» информации не последовало[23]. При этом бывший исполнительный директор Сергей Гореликов заявил, что не вернется в клуб Михаила Литвина[24].
↑[sport24.ru/news/football/2020-07-07-bloger-pranker-litvin-osnoval-lyubitelskiy-klub-za-dva-dnya-on-nabral-190-tysyach-podpischikov-v-instagrame Блогер-пранкер Литвин основал любительский клуб. За 2 дня он набрал 190 тысяч подписчиков в инстаграме](рус.). sport24.ru (7 июля 2020). Дата обращения: 5 августа 2022. Архивировано 24 сентября 2020 года.
↑ 12[sport24.ru/news/football/2022-07-31-sudeyskiye-skandal-sakhalinets-2-liga-litvin-udaril-sudyu-video-politsiya-podrobnosti Скандал в русском футболе: после матча ударили судью, это сделал президент клуба. Вызывали полицию](рус.). sport24.ru (31 июля 2022). Дата обращения: 5 августа 2022. Архивировано 5 августа 2022 года.
Некоторые внешние ссылки в этой статье ведут на сайты, занесённые в спам-лист
Эти сайты могут нарушать авторские права, быть признаны неавторитетными источниками или по другим причинам быть запрещены в Википедии. Редакторам следует заменить такие ссылки ссылками на соответствующие правилам сайты или библиографическими ссылками на печатные источники либо удалить их (возможно, вместе с подтверждаемым ими содержимым).