Представитель ружанской линии литовского магнатского рода Сапег герба «Лис». Единственный сын генерала литовского артиллерии князя Франциска Сапеги (1772—1829) и Пелагеи Розы Потоцкой (1775—1846).
В молодости Евстафий Каетан Сапега служил русской кавалерии, затем вышел в отставку и выехал за границу. Путешествовал по Европе и поселился в Великобритании, где получил гражданство, сохранив княжеский титул.
В 1829 году после смерти своего отца Евстафий Каетан Сапега унаследовал его обширные владения в Белоруссии.
Евстафий Каетан Сапега был дважды женат. 21 декабря1822 года женился на Марии Паттен Больд (1795—1824), от брака с которой детей не имел.
В 1842 году вторично женился на графине Розалии Юлии Мостовской (1809—1864), фрейлине двора (1829), дочери графа Тадеуша Антония Мостовского (1766—1842) и Марианны Потоцкой (1780—1837). Дети:
Евстафий Франтишек Сапега (7 октября1836 — 23 декабря1909), жена Адела Кларисса, дочь Франциска Карона и Клариссы Бланк
Анна Мария Аниела Сапега (18 сентября 1843 — 10 декабря 1919), жена с 1862 года графа Владислава Браницкого (ум. 1884)
Энцыклапедыя гісторыі Беларусі. У 6 т. Т. 6. Кн. 1: Пузыны — Усая / Беларус. Энцыкл.; Рэдкал.: Г. П. Пашкоў (галоўны рэд.) і інш.; Маст. Э. Э. Жакевіч. — Мн.: БелЭн, 2001. — 591 с.: іл. ISBN 985-11-0214-8.