Йосип Рунянин родился в сербской семье[3] в декабре 1821 году. Был крещен в сербской православной церкви в Винковцах. В этом же городе получил образование, а затем учился в городе Сремски-Карловци. Служил в австрийском императорском войске в качестве кадета на военной границе в городе Глина[4]. Во время службы получил чин капитана, а также, благодаря военному оркестру, научился играть на фортепиано. Во время службы заинтересовался движением иллиристов и познакомился с поэтом Антоном Михановичем[5]. Общепризнанно, что Рунянин, не будучи профессиональным композитором, написал музыку к патриотической хорватской песни Михановича «Наша прекрасная Родина» (хорв.Lijepa naša domovina) в 1846 году. По словам хорватского музыковеда Йосип Андреиса, Рунянин в своей музыке использовал арию sole piu ratto a sorger t’appresta из 3 акта оперы Лючия ди Ламмермур итальянского композитора Гаэтано Доницетти. Его песня Ljubimo te naša diko, по мотивах оперы Гаэтано ДоницеттиЛюбовный напиток[4] была написана в честь бана Хорватии Йосипа Елачича[6]. Хорватский гимн был впервые исполнен на улицах Загреба в 1891 году во время хорватского-славонской выставки[7].
Позже, Рунянин дослужился до полковника. В 1864 году, в возрасте 43 лет, Рунянин женился на дочери капитана Тома Петковича. В 1865 году избран в Хорватский сабор[8]. После выхода на пенсию переехал в Нови-Сад, где умер 2 февраля1878 года.
Похоронен на кладбище в городе Нови-Сад.
Память
В честь Йосипа Рунянина названо несколько школ в Хорватии. Также его имя носит музыкальная школа в Винковичах (хорв.Osnovna glazbena škola Josipa Runjanina)[9].