Псилофит — устаревшее название от греч.ψιλός — «голый».
В современной классификации псилофиты — синоним вымершего порядка Тримерофитовые (Trimerophytales Bold et al., 1987) высших споровых растений класса Риниофиты[2].
Даусон (англ.J. W. Dawson) в 1859 году осознал, что ветвящиеся безлиственные окаменелости девонского периода напоминают современный псилот[англ.], и придумал для ископаемого растения название псилофитон[англ.]. При этом прошло более ста лет от открытия этих растений до выбора типового экземпляра и надёжного описания. В промежутке нечёткая классификация критических особенностей — положения спорангия и строения стел — привела к общей таксономии для несвязанных растений.
Собственно таксон Psilophytites был введён О. А. Хёгом[англ.] в 1952 году для описания окаменевших стеблей, которые не могли быть точно расклассифицированы, обычно из-за отсутствия спорангия.