Правительство Южного Судана — исполнительная власть на территории Южного Судана, действующая в соответствии с конституцией и существующими законами. Правительство состоит из президента Салва Киира, вице-президента Рика Мачара и министров. Правительство в стране появилось в 2005 году на основе Найвашского соглашения, которым закончилась Вторая гражданская война в Судане. Большинство министров являются членами Народной армии освобождения Судана. Правительство расположено в столице страны — Джубе.
Правительство Южного Судана насчитывает 31 министерство: