Уезд образован при формировании Семиреченской области в 1867 году. Первоначальное название — Токмакский уезд с центром в селе Большой Токмак (в настоящее время город Токмак Чуйской области Кыргызстана). В связи с принятием 25 марта (6 апреля) 1891 года Положения об управлении Акмолинской, Семипалатинской, Семиреченской, Уральской и Тургайской областями уезд был переименован в Пишпекский, а его центром стал Пишпек.
В 1906 году состоял из трёх участков: Пишпекского, Беловодского и Токмакского.
Юго-западная часть уезда рядом с озером Иссык-Куль была гориста. Горный хребет Александровский тянулся также в юго-западном направлении уезда. На севере — пустынная степь, по которой протекает река Чу.
Хозяйственная деятельность
Основным занятием крестьянского населения было земледелие на плодородных землях долины реки Чу. По склонам Александровского хребта сеялись яровая и озимая пшеница, ячмень, овёс, рис, просо, рожь и картофель. Крестьяне также разводили арбузы, дыни, тыквы, огурцы.
Кочевое население занималось скотоводством.
Также у местного населения были развиты охота, рыболовство и пчеловодство.
Несмотря на наличие в уезде полезных ископаемых, промышленность, в том числе горная, была не развита. К 1893 году в уезде действовали: конский и сыроваренный заводы, 41 незначительные фабрика и заводы (преимущественно мельницы), а также ремесленники.