С 1948 года — секретарь районного, позже — городского (1950—1951)[4] комитета КПСС г. Молотова (Перми), секретарь Сахалинского областного комитета КПСС, заведующий отделом пропаганды и агитации Иркутского областного комитета КПСС.
С 1962 до последних дней на Кольском полуострове: в 1962-1971 годах — секретарь Мурманского областного комитета КПСС. В тот же период одновременно — заведующий отделом пропаганды и агитации (1963-1965).
Исследователи П. В. Фёдоров и А. Н. Синицкий называют В. И. Мочалова «просвещённым идеологом», «главным партийным идеологом Мурманской области 1960-х — начала 1970-х годов»; в этом качестве он курировал все связи местной власти с интеллигенцией. Работая в качестве заведующего отделом пропаганды и агитации Мурманского областного комитета КПСС (1963-1965), он провёл празднование важных в идеологическом отношении юбилеев: 1965 год — 30-летие победы; 1967 год — 50-летие Октябрьской революции; 1968 год — 50-летие комсомола; 1970 год — 100-летие В. И. Ленина[6].
Как секретарь Мурманского областного комитета КПСС, В. И. Мочалов пользовался немалым авторитетом. В 1969 году при его участии были изданы «Очерки истории Мурманской организации КПСС», написанные группой ученых-историков местных вузов. Под руководством В. И. Мочалова было осуществлено строительство в Мурманске Дома политпросвещения[7] (позже — филармония[8]) на улице Софьи Перовской[9].