Уже в 1854 году он был награждён малой серебряной медалью; а в 1855 году — большой серебряной медалью . В 1857 году он был удостоен малой золотой медали за проект театрального училища с принадлежащим к нему театром; в 1858 году, при выпуске из академии, за проект католического собора получил звание классного художника; в 1859 году за этот же проект и за другие работы получил звание академика Императорской академии художеств.
Начав около этого времени приобретать все большую и большую практику у петербургских домовладельцев, преимущественно из богатого купечества, Михаил Алексеевич Макаров быстро занял видное место среди русских зодчих, как мастер соединять красивость фасадов и вообще отделки зданий с их приспособленностью к тем целям, для которых они предназначены.
Из многочисленных построек, произведённых им в Санкт-Петербурге, в особенности заслуживают быть упомянутыми дома М. И. Лопатина, А. Г. Тройницкого, С. И. Крундышева, Лесниковых[2], Базилевского[уточнить], Громовой, И. И. Антонова, А. Ф. Паулучи, причта Исаакиевского собора, подворья Троицко-Сергиевой лавры, дом для князя Васильчикова, дом А. В. Липгарта.
Кроме того в период 1865—1867 годы он построил восемь дач в имении княгини Кушелевой «Лигово» и часовню для княгини Т. Д. Строгановой.
Им составлено немало архитектурных проектов и произведено построек по его службе в Опекунском совете; самым удачным произведением может считаться новое здание Санкт-Петербургского коммерческого училища (в Чернышёвом переулке (улица Ломоносова). За это здание и за дом Лопатина Академия художеств в 1867 году наградила художника званием профессора. В 1868 году он был выбран членом строительного комитета при IV Отделении Собственной Его Величества Канцелярии. Состоял также в Хозяйственной Строительной Городской Комиссии и почетным членом детских приютов. Член Петербургского общества архитекторов с 1870 года.
Жизнь талантливого архитектора прервалась 19 ноября 1873 года, после пожара в доме Антонова, где жил Макаров. Похоронен он был на Никольском кладбище Александро-Невской лавры. После смерти Макарова начатые им постройки завершал его ученик А. В. Иванов[3].
Проекты
Деревянный дом в имении Волышово графа А. С. Строганова, Порховский уезд Псковской губернии. Начало 1860-х. (Перестроен в камне К. К. Шмидтом).
Ковенский переулок, д.№ 12 — отделка домовой церкви Сергиевского приюта. 1872. (Не сохранилась).
Кузнечный переулок, д.№ 22, левая часть — Лиговский проспект, д.№ 67, правая часть — доходный дом. 1872. Включен существовавший дом.
1-я Красноармейская улица, д.№ 1, левая часть — здание Ремесленного училища им. цесаревича Николая. 1872—1874. Фасад. Планировка и строительство — Н. П. Гребенка. (Перестроено).
Власов В. Г. Макаров Михаил Алексеевич // Стили в искусстве : Архитектура, графика. Декоративно-прикладное искусство. Живопись, скульптура : словарь : в 3 т. / В. Г. Власов. — СПб. : Кольна, 1997. — Т. 3 : М—Я. — С. 10. — 655 с., [8] л. ил. — ISBN 5-88737-010-6. — OCLC605179863.
Зодчие Санкт-Петербурга. XIX — начало XX века / сост. В. Г. Исаченко; ред. Ю. Артемьева, С. Прохватилова. — СПб.: Лениздат, 1998. — 1070 с. — ISBN 5-289-01586-8.
Бурдяло А. В.Историческая справка // Акт по результатам государственной историко-культурной экспертизы проектной документации по сохранению выявленного объекта культурного наследия «Дом Соболевых», расположенного по адресу: Санкт-Петербург, ул. Чайковского, д. 79 лит. А (кв. 3-13, 38) — проект приспособления объекта культурного наследия для современного использования. — 2015. — 18 сентября. — С. 11-20.
